甲基化测序
来源:忠科检测
忠科检测提供的甲基化测序,甲基化测序是一种研究DNA甲基化的分子生物学技术,主要用于检测和定量分析基因组中CpG位点或其他类型的甲基化位点的甲基化状态,出具具有CMA,CNAS资质报告。

甲基化测序是一种研究DNA甲基化的分子生物学技术,主要用于检测和定量分析基因组中CpG位点或其他类型的甲基化位点的甲基化状态。DNA甲基化是表观遗传调控的重要方式之一,它通过在胞嘧啶(C)的5'碳位添加一个甲基基团,形成5-甲基胞嘧啶(5-mC),进而影响基因表达调控、细胞分化以及多种生物过程。
在甲基化测序中,首先需要对DNA进行处理,如亚硫酸氢盐转化或者酶切等方法将甲基化信息转化为可检测的序列差异,然后通过高通量测序技术(如全基因组 bisulfite 测序、Reduced Representation Bisulfite Sequencing 等)对样本DNA进行测序,最后通过生物信息学分析来解析全基因组或目标区域的DNA甲基化模式,从而揭示其在生物学功能及疾病发生发展中的作用。
检测目的
甲基化测序是一种研究DNA甲基化状态的分子生物学技术,其主要目的是:
1. **表观遗传学研究**:DNA甲基化是重要的表观遗传调控机制之一,它不改变DNA序列,但可以影响基因表达。通过甲基化测序,科学家可以研究特定基因或全基因组范围内的甲基化模式,揭示环境、发育阶段、疾病状态等因素如何通过调控DNA甲基化影响基因功能和细胞命运决定。
2. **疾病诊断与预后评估**:在许多疾病(如癌症)中,DNA甲基化模式会发生异常变化。通过分析这些变化,有助于疾病的早期诊断、预后评估以及个性化治疗方案的设计。
3. **药物研发与治疗靶点发现**:对甲基化模式的研究可以帮助科学家发现新的药物作用靶点,并为开发针对表观遗传调控异常的新型疗法提供依据。
4. **动植物育种及遗传改良**:在农业科学领域,甲基化测序也被用于研究作物和家畜的表观遗传变异,以期优化育种策略,提高生产性能和抗逆性。
5. **发育生物学研究**:甲基化在胚胎发育、细胞分化等过程中起着关键作用,甲基化测序能帮助我们理解这些复杂生命过程中的表观遗传调控机制。
检测项目
甲基化测序项目是一种研究DNA甲基化的高通量测序技术,主要用来检测和解析全基因组范围内CpG位点或其他类型的甲基化位点的甲基化状态。DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容,它不改变DNA序列本身,但能调控基因表达,影响细胞分化、发育以及许多疾病的发生发展。
在甲基化测序项目中,常见的技术包括全基因组 bisulfite 测序(Whole-genome Bisulfite Sequencing, WGBS)、减少代表性亚硫酸氢盐测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS)以及靶向甲基化测序(Targeted Bisulfite Sequencing)等。
这些项目通常会经历以下几个步骤:
1. DNA提取与处理:首先从样本中提取DNA,并通过亚硫酸氢盐转化将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶则保持不变。
2. 文库构建与测序:对转化后的DNA进行PCR扩增,构建测序文库,然后利用高通量测序平台进行测序。
3. 数据分析:对测序数据进行比对、甲基化位点鉴定、甲基化水平计算等相关生物信息学分析,从而揭示特定样本或实验条件下DNA甲基化模式及其生物学意义。
检测流程
甲基化测序通常是指由专业基因检测公司或研究机构提供的DNA甲基化测序服务,其基本流程如下:
1. 样品准备:首先,客户提供相应的生物样本(如血液、组织、细胞等),服务商对样本进行DNA提取和纯化。
2. 亚硫酸氢盐转化:这是甲基化测序的关键步骤,通过将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,从而实现对甲基化状态的区分。
3. 文库构建:将转化后的DNA片段化,添加接头,进行PCR扩增,构建测序文库。在这个过程中,可能还会包括甲基化 enrichment 的步骤,比如利用甲基化特异性的抗体进行富集。
4. 测序:将构建好的文库加载到高通量测序平台上(如Illumina NovaSeq、HiSeq等),进行大规模并行测序。
5. 数据分析:主要包括原始数据质量控制、序列比对、甲基化位点识别与定量分析、差异甲基化区域(DMRs)鉴定、功能注释以及统计检验等步骤。
6. 结果解读与报告:基于数据分析结果,结合生物学背景知识,撰写详细的实验报告,并对重要发现进行解读和讨论。
需要注意的是,不同的测序策略和技术平台可能会在具体步骤上有所不同,例如WGBS(全基因组甲基化测序)和RRBS(减少代表性重亚硫酸氢盐测序)等方法在文库构建阶段有所区别。